Identifiants uniques

Comment créer l’identifiant SINP pour les données et les métadonnées?

Les identifiants uniques du SINP sont au format UUID.

Plusieurs manières permettent de générer ces identifiants:

• Générateur en ligne, exemple: https://www.uuidgenerator.net/

• PostgreSQL: module uuid-ssp

• Exemple de script:

ALTER TABLE  <nom_table_donnees>  ADD (IDENTIFIANT_PERMANENT VARCHAR(255));
/
DECLARE CURSOR C IS SELECT ROWID AS RID FROM <nom_table_donnees> ;
GUID VARCHAR(32);
BEGIN
FOR V_REC IN C
LOOP
GUID:=SYS_GUID();
UPDATE <nom_table_donnees> SET IDENTIFIANT_PERMANENT =
(SUBSTR(GUID,1,8)|| ‘-‘ ||SUBSTR(GUID,9,4)|| ‘-‘ ||SUBSTR(GUID,13,4)|| ‘-‘ ||SUBSTR(GUID,17,4)|| ‘-‘ ||SUBSTR(GUID,21,12))  where rowid=v_rec.rid;
END LOOP;
END;

Qui peut créer/générer l’identifiant SINP?

Il est préconisé que les identifiants du SINP soient gérés au plus près de la collecte des données, donc dans les bases de données sources lorsque cela est possible.

La production de l’identifiant au plus près du producteur de données facilite en effet la traçabilité des données et limite l’intégration de doublons.

Dans le cas où les identifiants uniques n’auraient pas été créés avant la transmission des données à une plateforme du SINP, les identifiants seront alors créés par la plateforme lors de leur intégration dans le dispositif.

Code de taxons

Quel code TAXREF inscrire dans la colonne CD_NOM lorsque l’espère n’a pas pu être identifiée précisément?

Dans le cas où l’espèce ne peut être identifiée précisément, on se réfèrera au code (cd_nom) du plus petit rang commun (noeud taxonomique commun).

Les cd_nom des rangs supra-spécifiques sont disponibles dans la table TAXREF téléchargeable sur le site de l’INPN.

Exemple: si l’observateur ne peut identifier une espèce de murin (grand ou petit murin), alors on inscrira le cd_nom du genre (60411) dans la colonne CD_NOM. On notera Grand/Petit murin dans la colonne nom_cité.

Y-a-t-il un outil permettant d’aider à attribuer un code de taxon (CD_NOM) à partir d’un nom d’espèce?

Les administrateurs de données peuvent être confrontés à la transmission de données de producteurs sans l’identifiant de l’espèce du référentiel TAXREF (CD_NOM).

Cela nécessite alors un traitement pour rattacher les espèces citées avec le référentiel.

Afin de faciliter ce traitement, nous proposons l’usage de l’outil TAXREF-Match : https://taxref.mnhn.fr/taxref-match

Cet outil permet de charger une liste de noms scientifiques d’espèces (jusqu’à 10 000) et d’obtenir en retour des propositions de CD_NOM.

Le service est également disponible sous forme de web-service dans l’API TAXREF (documentation ici : https://taxref.mnhn.fr/taxref-web/api/doc), bien que la réponse soit moins complète que sur l’application dédiée.

Par exemple : https://taxref.mnhn.fr/api/taxa/fuzzyMatch?term=buffo%20buffo%20linné%201758

Localisation

Si mon objet est un point GPS, quelle nature lui affecter ? Est-ce un objet stationnel ou inventoriel ?

Par définition, un objet est dit stationnel s’il est présent sur l’ensemble de l’objet géographique considéré. Si on a pris un point GPS pour l’observation, elle est donc considérée comme stationnelle. A contrario, si on a pris une commune et observé un oiseau quelque part sur la commune, la donnée est dite inventorielle.

Gestion des doublons

Comment gérer dans une plateforme une donnée privée transmise floutée dans un premier temps, puis transmise avec sa précision géographique maximale dans un second temps ? 

Il est conseillé de remplacer la première donnée par la seconde en gardant l’identifiant SINP.